Carente de fecha fundacional, los habitantes de Santa María reconocen la celebración de sus fiestas patronales cada 25 de junio, como fecha y festejo del origen del pueblo.
Primitivamente, esta zona perteneció a una comunidad indígena Comechingona que llevaba el nombre de Toaen, y abarcaba lo que hoy es Santa María, Cosquín, Bialet Massé y zonas vecinas.
Cuando el Gobierno Nacional adquiere el Sanatorio para enfermos de tuberculosis, en 1911, la Estación de Ferrocarril más cercana, de Bialet Massé, se llamaba Santa María. Era allí adónde llegaba la correspondencia para el hospicio, hasta que se inauguró una nueva estación más cercana al Sanatorio con el nombre de Santa María.
Hasta 1953 Santa María no tuvo municipio, y recién en 1958 el pueblo eligió un gobierno.